ახალი კორონავირუსის (SARS-Cov-2) ნუკლეინის მჟავების გამოვლენის ნაკრები
New Cოროnavirus(SARS-Cov-2) Nucleic Acid Detection Kit
(Fluმადანიscent RT-PCR Probe Method) Product Manual
【Pროდუკიt name 】ახალი კორონავირუსის (SARS-Cov-2) ნუკლეინის მჟავის გამოვლენის ნაკრები (ფლუორესცენტური RT-PCR გამოკვლევის მეთოდი)
【Packaging specთუcations 】25 ტესტი / ნაკრები
【Intended usასაკი】
ეს ნაკრები გამოიყენება ახალი კოროვირუსისგან ნუკლეინის მჟავის ხარისხობრივი გამოვლენისთვის ცხვირ-ხახის ნაცხში, ოროფარინგეალური (ყელის) ნაცხში, წინა ცხვირის ტამპონებში, შუა ტურბინის ტამპონებში, ცხვირის სარეცხსა და ცხვირის ასპირატებში იმ პირებისგან, რომლებიც ეჭვმიტანილია COVID19-ზე მათი ჯანდაცვის პროვაიდერის მიერ. ახალი კორონავირუსის ORF1ab და N გენების გამოვლენა შეიძლება გამოყენებულ იქნას ახალი კოროვირუსული ინფექციის დამხმარე დიაგნოსტიკისა და ეპიდემიოლოგიური მონიტორინგისთვის.
【Principles of the pროცეdure 】
ეს ნაკრები განკუთვნილია სპეციფიკური TaqMan ზონდებისთვის და სპეციფიკური პრაიმერებისთვის, რომლებიც შექმნილია ახალი კორონავირუსის (SARS-Cov-2) ORF1ab და N გენის თანმიმდევრობებისთვის. PCR რეაქციის ხსნარი შეიცავს სპეციფიური პრაიმერებისა და ფლუორესცენტური ზონდების 3 კომპლექტს სამიზნეების სპეციფიკური გამოვლენისთვის, ხოლო სპეციფიკური პრაიმერებისა და ფლუორესცენტური ზონდების დამატებითი ნაკრები გამოიყენება, როგორც ნაკრების შიდა სტანდარტის კონტროლი ენდოგენური საყოფაცხოვრებო გენების გამოსავლენად.
ტესტის პრინციპი არის ის, რომ სპეციფიური ფლუორესცენტური ზონდი იშლება და იშლება Taq ფერმენტის ეგზონუკლეაზური აქტივობით PCR რეაქციაში, ასე რომ მომხსენებელი ფლუორესცენტური ჯგუფი და ჩამქრალი ფლუორესცენტური ჯგუფი გამოიყოფა, რათა ფლუორესცენტული მონიტორინგის სისტემამ მიიღოს ფლუორესცენტი. სიგნალი, და შემდეგ PCR გამაძლიერებელი ეფექტის მეშვეობით, ზონდის ფლუორესცენტური სიგნალი აღწევს დადგენილ ბარიერის მნიშვნელობას - Ct მნიშვნელობას (ციკლის ბარიერი). სამიზნე ამპლიკონის არარსებობის შემთხვევაში, ზონდის მომხსენებელი ჯგუფი ახლოსაა ჩაქრობის ჯგუფთან. ამ დროს ხდება ფლუორესცენტული რეზონანსული ენერგიის გადაცემა და რეპორტიორის ჯგუფის ფლუორესცენცია ჩაქრება ჩაქრობის ჯგუფის მიერ, ისე რომ ფლუორესცენტური სიგნალის აღმოჩენა შეუძლებელია ფლუორესცენტური PCR ინსტრუმენტით.
ტესტის დროს რეაგენტების გამოყენების მონიტორინგის მიზნით, ნაკრები აღჭურვილია დადებითი და უარყოფითი კონტროლით: დადებითი კონტროლი შეიცავს სამიზნე ადგილზე რეკომბინანტულ პლაზმიდს, ხოლო უარყოფითი კონტროლი არის გამოხდილი წყალი, რომელიც გამოიყენება გარემოს დაბინძურების მონიტორინგისთვის. ტესტირებისას რეკომენდებულია დადებითი და უარყოფითი კონტროლის დაყენება ერთდროულად.
【Main comპონენიts 】
Cat. No. | BST-SARS-25 | BST-SARS-DR-25 | კომპონენტები | |
ნამe | სპეცფიკაცია | კვანტით | კვანტით | |
პოზიტიური კონტროლი | 180 მკლ/ფლაკონი | 1 | 1 | ხელოვნურად აგებული პლაზმიდები, გამოხდილი წყალი |
უარყოფითი კონტროლი | 180 მკლ/ფლაკონი | 1 | 1 | გამოხდილი წყალი |
SARS-Cov-2 მიქსი | 358.5 მკლ/ფლაკონი | 1 | / | სპეციფიკური პრაიმერის წყვილი, სპეციფიკური გამოვლენის ფლუორესცენტური ზონდები, dNTPs, MgCl2, KCl, Tris-Hcl, გამოხდილი წყალი და ა.შ. |
ფერმენტის მიქსი | 16,5 მკლ/ფლაკონი | 1 | / | Taq ფერმენტები, საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა, UNG ფერმენტები და ა.შ. |
SARS-Cov-2 Mix (ლიოფილიზებული) | 25 ტესტი/ფლაკონი | / | 1 | სპეციფიკური პრაიმერის წყვილი, სპეციფიკური გამოვლენის ფლუორესცენტური ზონდები, dNTPs, Taq ფერმენტები, საპირისპირო ტრანსკრიპტაზა, გამოხდილი წყალი და ა.შ. |
2x ბუფერი | 375 მკლ/ფლაკონი | / | 1 | MgCl2, KCl, Tris-Hcl, გამოხდილი წყალი და ა.შ. |
შენიშვნა:(1) კომპონენტები სხვადასხვა პარტიულ კომპლექტებში არ შეიძლება იყოს შერეული ან გაცვლა.
(2) მოამზადეთ საკუთარი რეაგენტი: ნუკლეინის მჟავის ექსტრაქციის ნაკრები.
【Storage conditions და expiration date 】
For BST-SARS-25:ტრანსპორტირება და შენახვა -20±5℃ დიდი ხნით.
For BST-SARS-DR-25:ტრანსპორტირება ოთახის ტემპერატურაზე. ინახება -20±5℃ ტემპერატურაზე დიდი ხნის განმავლობაში.
მოერიდეთ გაყინვა-დათბობის განმეორებით ციკლებს. მოქმედების ვადა სავარაუდოთ 12 თვეა.
იხილეთ ეტიკეტზე დამზადებისა და გამოყენების თარიღი.
პირველი გახსნის შემდეგ რეაგენტი შეიძლება ინახებოდეს -20±5°C ტემპერატურაზე არა უმეტეს 1 თვის განმავლობაში ან რეაგენტის პერიოდის დასრულებამდე, რომელი თარიღიც არ უნდა იყოს პირველი, რათა თავიდან იქნას აცილებული გაყინვა-დათბობის განმეორებითი ციკლები და რეაგენტის გაყინვის რაოდენობა. -დათბობის ციკლი არ უნდა აღემატებოდეს 6-ჯერ.
【Applicable instrument】ABI 7500, SLAN-96P, Roche-LightCycler-480.
【Sample requirements 】
1. გამოსაყენებელი ნიმუშის ტიპი: ექსტრაქტული ნუკლეინის მჟავის ხსნარი.
2. ნიმუშის შენახვა და ტრანსპორტირება: შეინახეთ -20±5℃-ზე 6 თვის განმავლობაში. გაყინეთ და გალღვეთ ნიმუშები არა უმეტეს 6-ჯერ.
【Testing metჰოდ】
1.Nucleic acid extraction
აირჩიეთ ნუკლეინის მჟავის ექსტრაქციის შესაფერისი ნაკრები ვირუსული ნუკლეინის მჟავის გამოსაყვანად და მიჰყევით ნაკრების შესაბამის ინსტრუქციას. რეკომენდირებულია გამოიყენოთ ნუკლეინის მჟავის ექსტრაქციისა და გამწმენდი ნაკრების მიერ წარმოებული Yixin Bio-Tech (Guangzhou) Co., Ltd. ან ექვივალენტი ნუკლეინის მჟავას გამწმენდი ნაკრები.
2. Reaction რეაჟიnt prepარაtion
2.1 For BST-SARS-25:
(1) ამოიღეთ SARS-Cov-2 Mix და Enzyme Mix, მთლიანად გადნება ოთახის ტემპერატურაზე, კარგად აურიეთ Vortex-ის აპარატით და შემდეგ მოკლედ გააკეთეთ ცენტრიფუგა.
(2) 16.5მლ ფერმენტული ნარევი დაემატა 358.5მლ SARS-Cov-2 მიქსს და საფუძვლიანად შერეულია შერეული რეაქციის ხსნარის მისაღებად.
(3) მოამზადეთ სუფთა 0.2 მლ PCR რვავიანი მილი და მონიშნეთ 15 მლ ზემოთ შერეული რეაქციის ხსნარით თითო ჭაბურღილში.
(4) დაამატეთ 15 μL გაწმენდილი ნუკლეინის მჟავას ხსნარი, დადებითი კონტროლი და უარყოფითი კონტროლი და ფრთხილად დააფარეთ რვავის მილის თავსახური.
(5) კარგად აურიეთ თავდაყირა გადაბრუნებით და სწრაფად მოათავსეთ ცენტრიფუგა სითხის კონცენტრირებისთვის მილის ძირში.
1
2.2 For BST-SARS-DR-25:
(1) დაამატეთ 375 მლ 2x ბუფერი SARS-Cov-2 Mix-ში ((ლიოფილიზებული) რეაქციული ნარევის მოსამზადებლად. საფუძვლიანად აურიეთ პიპეტინგით და შემდეგ მოკლედ ცენტრიფუგა. გრძელვადიანი შენახვა.)
(2) მოამზადეთ სუფთა 0.2 მლ PCR რვატული მილი და მონიშნეთ 15 μL რეაქციის ნარევით თითო ჭაბურღილში.
(3) დაამატეთ 15 μL გაწმენდილი ნუკლეინის მჟავას ხსნარი, დადებითი კონტროლი და უარყოფითი კონტროლი და ფრთხილად დააფარეთ რვავის მილის თავსახური.
(4) კარგად აურიეთ თავდაყირა გადაბრუნებით და სწრაფად მოათავსეთ ცენტრიფუგა სითხის კონცენტრირებისთვის მილის ძირში.
3. PCR ampლიფიcation (ოპერაციული პარამეტრებისთვის იხილეთ ინსტრუმენტის სახელმძღვანელო.)
3. 1 მოათავსეთ PCR 8-მილაკი ფლუორესცენტური PCR ინსტრუმენტის სინჯის კამერაში და დააყენეთ შესამოწმებელი ნიმუში, დადებითი კონტროლი და უარყოფითი კონტროლი დატვირთვის თანმიმდევრობის მიხედვით.
3.2 ფლუორესცენციის გამოვლენის არხი:
(1) ORF1ab გენი ირჩევს FAM-ის გამოვლენის არხს (რეპორტიორი: FAM, ჩამქრალი: არანაირი).
(2) N გენი ირჩევს VIC-ის გამოვლენის არხს (რეპორტიორი: VIC, ჩამქრალი: არ არის).
(3) შიდა სტანდარტის გენი ირჩევს CY5-ის გამოვლენის არხს (რეპორტიორი: CY5, ჩამქრალი: არ არის).
(4) პასიური მითითება დაყენებულია ROX-ზე.
3.3 PCR პროგრამის პარამეტრის დაყენება:
ნაბიჯი | ტემპერატურა (℃) | დრო | ციკლების რაოდენობა | |
1 | საპირისპირო ტრანსკრიფციის რეაქცია | 50 | 15 წთ | 1 |
2 | Taq ფერმენტის გააქტიურება | 95 | 2,5 წთ | 1 |
3 | Taq ფერმენტის გააქტიურება | 93 | 10 წმ | 43 |
ანეილირების გაფართოება და ფლუორესცენციის შეძენა | 55 | 30 წ |
დაყენების შემდეგ შეინახეთ ფაილი და გაუშვით რეაქციის პროგრამა..
4.Results analysis
პროგრამის დასრულების შემდეგ, შედეგები ავტომატურად შეინახება და გაძლიერების მრუდი გაანალიზებულია. გაძლიერების მრუდი დაყენებულია ინსტრუმენტის ნაგულისხმევ ზღურბლზე.
【Explanation of test results 】
1. განსაზღვრეთ ექსპერიმენტის ვალიდობა: დადებით საკონტროლო FAM, VIC არხს უნდა ჰქონდეს ტიპიური გამაძლიერებელი მრუდი და Ct-ის მნიშვნელობა ზოგადად 34-ზე ნაკლებია, მაგრამ შეიძლება მერყეობდეს სხვადასხვა ინსტრუმენტის ზღურბლის სხვადასხვა პარამეტრების გამო. უარყოფითი კონტროლი FAM, VIC არხი უნდა იყოს არაგაძლიერებული Ct. შეთანხმებულია, რომ ზემოაღნიშნული მოთხოვნები ერთდროულად უნდა დაკმაყოფილდეს, წინააღმდეგ შემთხვევაში ეს ტესტი ბათილად ითვლება.
2. შედეგის განსჯა
FAM/VIC არხი | განსჯის შედეგი |
Ct<37 | ნიმუშის ტესტი დადებითია |
37≤Ct<40 | ამპლიფიკაციის მრუდი S-ის ფორმისაა და საეჭვო ნიმუშები საჭიროებს ხელახლა გამოკვლევას; თუ ხელახალი შემოწმების შედეგები თანმიმდევრულია, იგი ფასდება როგორც დადებითი, წინააღმდეგ შემთხვევაში - უარყოფითი |
Ct≥40 ან გაძლიერების გარეშე | ნიმუშის ტესტი უარყოფითია (ან ნაკრების გამოვლენის ქვედა ზღვარზე ქვემოთ) |
შენიშვნა: (1) თუ ორივე FAM არხი და VIC არხი ერთდროულად დადებითია, SARS-Cov-2 განისაზღვრება დადებითად.
(2) თუ FAM არხი ან VIC არხი დადებითია, ხოლო მეორე არხი უარყოფითია, ტესტი უნდა განმეორდეს. თუ ის ერთდროულად დადებითია, შეფასდება როგორც SARS-Cov-2 დადებითი, წინააღმდეგ შემთხვევაში შეფასდება როგორც SARS-Cov-2 უარყოფითი.